Molecular Biophysics:
Structural and energetic characterization of the DNA in the quantum mechanical framework
Development of interdisciplinary methods to establish a link of molecular dynamics with thermodynamics and fluid mechanics
Development of quantum mechanical methods and their applications to molecular systems
Grants/Projects
Renovacion de Proyecto: Desarrollo de métodos de simulación computacional aplicados al área de biofísca molecular
Fecha de vigencia: enero de 2019 - diciembre de 2019, finalizado, 2019-2019, Dirección General de Asuntos del Personal Académico,
INTERACCIONES MOLECULARES DE LA MATERIA A LA NANOESCALA:
UN ENFOQUE TEORICO-EXPERIMENTAL, 2016-2017, Instituto de Física,
Development of a Massive Parallel Multiscale Simulation Software for Chemistry
, 2016-2018, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología,
Calculos de primeros principios de la distribucion electronica y estructural de nanoparticulas a alta presion, 2013-2013, Laboratorio de Rayos-X,
Estudio de moléculas biológicas tipo ADN y sus interacciones con otros compuestos biologicos, 2010-2016, Otra,
Latest Articles
Oscar Gutiérrez-Varela, Julien Lombard, Thierry Biben, Ruben Santamaria, Samy Merabia, Wetting controlled boiling at the nanoscale (bajo refereo actualmente), Physical Review Letters, December 2022; x(x), x,
R. Santamaria, J. Soullard
, Particle dynamics in the NPT ensemble from extended Lagrangians
(bajo refereo actualmente), Molecular Simulation, November 2022; x(x), x,
O. Gutiérrez-Varela, S. Merabia, R. Santamaria, Size-dependent effects of the thermal transport at gold nanoparticle-water interfaces, Journal of chemical physics, July 2022; 157(2022), 084702, DOI: 10.1063/5.0096033, Link
C. J. Ordoñez Martínez, D. Martínez-Zapata, R. Santamaria, Dissociation of the Watson-Crick base pairs in vacuum and in aqueous solution: a first-principles molecular dynamics study, Jour. Biomolec. Struct. & Dyn., October 2021, DOI: 10.1080/07391102.2021.1987988,
E. Hernández-Huerta, R. Santamaria, Tomás Rocha-Rinza, Thermodynamics from Lagrangian theory and its applications to nanosize sytems
, Molecular Physics, January 2021, DOI: 10.1080/00268976.2021.1940333,
Former Students
Eduardo Hernández Huerta, Primera ley de la termodinámica a partir de teoría Lagrangiana y su aplicación en sistemas nanométricos, 2022-03-25, Doctorado
Daniel Martínez Zapata
, Daño causado en las bases nucleicas de tipo Watson-Crick por nanopartículas de níquel : un estudio de dinámica molecular cuántica
, 2020-10-28, Doctorado
Oscar Javier Gutíerrez Varela, Validando la ley de Stokes a escala molecular, 2019-08-30, Maestría
Cristian Joel Ordóñoz Martínez,
, Calculos de las Fuerzas de puentes de hidrogeno en los pares de bases Watson-Crick simulando AFM con SMD, 2017-07-06, Maestría
Antonio Álvarez de la Paz
, Modelo de confinamiento molecular con efectos de presión y temperatura
, 2017-02-28, Maestría
Technical Reports
Réferi de 4 proyectos
Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT)
Dirección de Investigación (CONACyT), Ruben Santamaria, Propuesto, 0242880 0237555 0237185 0240904, 01 Nov 2014, 100, November 2014
Réferi de proyecto
Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), DGAPA, Ruben Santamaria, Propuesto, IN-109915, 20 Oct 2014, 25, October 2014
Réferi de proyecto Posdoctoral (No. Reg. 00122888)
Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT)
Responsable de Comité de Evaluación de Estancias al Extranjero: Q.F.B. Miguel I. Rodríguez, Ruben Santamaria, Aceptado, , , , February 2010
Sinodal en examen de Doctorado
Estudiante: Eduardo Rangel Cortés
Tesis: Adsorción de H2O y H2 en superficies de carbono
Instituto de Física, UNAM, Ruben Santamaria, Aceptado, , , , February 2010
Sinodal de tesis de Maestría
Estudiante: Adrián Mauricio Escobar Ruiz
Tesis: Aproximaciones electrostáticas para cadenas moleculares hidrogenoides de 1 y 2 electrones en campos magnéticos intensos
Instituto de Ciencias Nucleares, UNAM, Ruben Santamaria, Aceptado, , , , January 2010